優良な事業だけを新会社に引き継ぎ、採算の悪い事業だけを残した会社を破産させてもいいのでしょうか？

不可能ではありませんが、お勧めできません。
事業再生の手法として事業譲渡、会社分割により事業の一部ないし全部を承継させる手法はあります。しかし、会社分割により不採算事業のみ残された元の会社の債権者による取消を認めた裁判例もあります。また、改正後の会社法要綱でも、元の会社が債権者を害することを知って会社分割をした場合、債権者が事業の承継会社に対しても承継した財産の価額を限度として債務の履行を請求することを認めています。